出口代理公司退税一般有以下流程。首先，出口企业要及时将出口业务相关的单证，如报关单、发票、核销单等交给代理公司。代理公司收到后，会对这些单证进行审核，确保单证信息准确无误。

其次，代理公司登录电子税务局，进入出口退税申报系统，录入相关出口退税申报数据，并生成申报电子数据。然后，将生成的申报数据以及纸质申报资料，按照规定向当地税务机关进行申报。

税务机关受理后，会进行审核、审批。若审核通过，退税款会先打到代理公司账户，代理公司再转给委托企业。需要注意的是，单证收集要及时准确，申报要在规定时间内完成，避免逾期影响退税。

出口代理公司退税得先跟委托企业明确好双方责任，确保资料交接顺畅。并且要关注汇率波动，因为这可能影响退税金额计算。

代理公司退税时，要保证出口货物的真实性，不然被查到虚假退税麻烦就大了。另外，对于一些特殊商品的退税政策，要提前了解清楚。

退税申报时，相关表格填写不能出错，像报关单上的商品代码、数量、金额等信息，都要和其他单证对应上，不然税务机关审核不通过。

出口代理公司要和税务机关保持良好沟通，有新政策变化能及时知晓，同时若退税申报遇到问题也能快速解决。

委托企业给代理公司的资料要齐全，像采购合同等，不然代理公司无法完整准备退税申报资料。

代理公司要熟悉不同贸易方式下的退税规则，比如一般贸易和加工贸易退税就有差别。

在退税流程中，对退税款的核算要准确，不能多算少算，不然对委托企业和自身信誉都有影响。

出口代理公司要定期对退税业务进行自查，看看流程有无漏洞，及时改进，保障退税工作顺利。