在审计出口代理时，首先要关注合同协议。审查合同条款是否明确双方权利义务，如代理费计算方式、服务范围等，避免模糊不清引发纠纷。

其次，核实业务真实性。检查出口货物的真实性，包括货物来源、质量、数量等，可通过查看相关单据，如报关单、提单、装箱单等。

再者，关注资金流。确认代理费、货款等资金往来是否正常，有无异常资金流动或延迟支付等情况。

另外，审查出口代理企业资质。查看其是否具备相关出口代理资格，人员是否专业。还要留意税务处理，确保出口退税等税务操作合规，避免税务风险。

要关注出口代理操作流程是否规范，比如货物的运输、仓储安排是否合理，有没有因操作不当导致货物损失风险。

审计时需留意出口代理企业与客户的沟通记录，看是否及时准确传达各类信息，避免因沟通不畅产生问题。

关注出口代理企业对市场风险的应对措施，比如汇率波动时，有无相应的规避手段，防止给委托方造成损失。

审查出口代理业务文档管理，相关文件是否齐全、保存是否妥善，便于日后查询追溯。

查看出口代理企业的售后服务，如货物出口后出现问题，处理是否及时得当。

注意出口代理过程中的保险安排，货物运输保险等是否足额、有效，保障货物安全。

关注出口代理企业与供应商的合作稳定性，避免因供应商问题影响出口业务。

审计时看看出口代理企业的信息化管理水平，能否高效处理业务数据和信息。