代理出口报关单可以是双抬头，也可以是单抬头，这取决于企业的需求和具体业务情况。双抬头指的是经营单位和发货单位为不同的两家企业，经营单位通常是代理公司，发货单位为委托方。

双抬头报关单的好处在于，委托方可以凭借此报关单进行出口退税等操作，因为发货单位体现的是委托方信息。而单抬头报关单，经营单位和发货单位为同一企业，若采用代理出口并使用单抬头报关单，通常是以代理公司作为经营单位和发货单位，这种情况下委托方在出口退税等方面可能会面临一些复杂的手续，甚至有些地区可能无法办理退税。所以如果委托方要自行退税，一般建议采用双抬头报关单。不过，具体操作还需结合当地海关政策及税务要求。

不一定是双抬头。选择单抬头还是双抬头，要看代理和委托方协商，以及后续业务侧重哪方办理相关事务。若委托方只要货物出口数据，不在意退税等，单抬头也可行。

双抬头的话，能让委托方在某些业务环节更便利，像退税申报等。单抬头如果代理公司实力强，处理各类事务经验丰富，也能高效完成出口流程。

实际操作中，双抬头有利于明确双方责任。经营单位负责报关等手续，发货单位对货物实际情况负责。单抬头可能在责任界定上没那么清晰。

双抬头报关单对于委托方来说，在证明货物所有权等方面更有优势，单抬头则在以代理公司为主导的业务流程中较为简便。

代理出口选择双抬头，在财务核算上对委托方更清晰，便于其记录出口业务相关收支。单抬头可能导致财务核算相对复杂。

海关对单双抬头的监管要求基本一致，但在提交单证等细节上可能有差异，企业需按要求准备。

有些地区税务部门对双抬头报关单的退税审核更宽松，企业在选择抬头形式时，要考虑当地税务政策。

单抬头和双抬头各有利弊，企业可根据自身长期业务规划、与代理的合作模式等综合决定采用哪种形式。