第三方代理出口费用的承担主体通常由委托方和代理方在代理出口协议中明确约定。一般来说，代理费是委托方支付给代理方的服务报酬，用以感谢代理方提供出口相关服务，这笔费用自然由委托方承担。

报关费，它是为完成货物出口报关手续产生的，多数情况下也由委托方承担，毕竟是委托代理进行出口报关。运输费，如果委托方和代理方约定代理方负责运输，那运输费可能包含在代理费里由委托方承担；若委托方自行安排运输，那运输费就由委托方直接支付给运输公司。

总体原则是，明确双方权利义务，按协议执行费用承担，避免后续纠纷。

常见情况是委托方承担大部分费用，因为代理方主要提供代理服务，实际出口业务主体还是委托方，像报关、运输这些与出口紧密相关费用多由委托方出。

这得看谈代理合作时怎么说，要是委托方在价格上压得低，代理方说不定会分担部分费用，不过这种情况比较少。

代理费肯定委托方出，至于其他杂费，比如码头操作费等，可协商按一定比例分担，具体看双方谈判能力。

运输费如果代理方负责找货代安排运输，那委托方要给代理方这笔钱。要是委托方自己有合作货代，运输费就自己付。

保险费也有可能涉及，一般谁负责购买保险谁承担费用，多数是委托方要求代理方代买，费用由委托方出。

文件费等一些小费用，多数时候委托方承担，但如果代理方想促成合作，也可能主动承担部分。

有些代理出口还涉及退税手续费，这部分费用一般由委托方支付给代理方。

如果出口过程中有查验费，要是因代理方失误导致查验，代理方可能分担部分，正常情况委托方承担。