代理出口企业涉及的主要税种及相关情况如下：首先是增值税，在代理出口业务中，代理方一般不涉及增值税应税行为，委托方自行申报出口退税。若委托方是生产企业，实行免抵退税办法；若委托方是外贸企业，实行免退税办法。其次是企业所得税，代理出口企业以其代理服务取得的手续费收入，计入应纳税所得额，按25%的税率缴纳企业所得税（符合小型微利企业等优惠条件的，适用相应优惠税率），计算方式为应纳税所得额×税率 。申报缴税流程方面，与一般企业基本相似，需按时进行纳税申报。但在出口退税资料留存上，要协助委托方做好相关资料整理，以备税务机关核查。

需注意不同地区政策可能存在细微差异，建议与当地税务机关保持密切沟通。

代理出口企业的印花税也不可忽视，按照代理合同金额的一定比例缴纳，具体税率要参照当地规定。

若代理出口业务涉及消费税应税货物，要注意委托方是消费税纳税人，不过代理方有协助其办理相关消费税事宜的责任。

企业在取得代理收入后，要及时确认收入，准确核算成本费用，这样才能正确计算企业所得税应纳税额。

出口退税相关资料要妥善保存，像报关单、发票等，万一税务检查时能快速提供。

在增值税方面，如果委托方无法提供合法有效的退税凭证，代理方可能会面临一些税务风险。

代理出口企业还要关注当地税收优惠政策，说不定能享受减免税待遇。

平时要多关注税务政策变化，尤其涉及出口退税和代理业务的，及时调整企业税务处理方式。

申报缴税时，要确保数据准确，不然可能面临税务处罚。